曾用刊名：植物遗传资源科学
《植物遗传资源学报》是中国农业科学院作物科学研究所和中国农学会主办的学术性刊物，是我国唯一一份以介绍植物遗传资源为主的期刊。2000年创刊，2003年正式公开发行，2000—2009年为季刊，2010年改刊期为双月刊。
报道内容为大田、园艺作物，观赏、药用植物，林用植物、草类植物及其一切经济植物的有关植物遗传资源基础理论研究、应用研究方面的研究成果、创新性学术论文和高水平综述或评论。诸如，种质资源的考察、收集、保存、评价、利用、创新，信息学、管理学等；起源、演化、分类等系统学；基因发掘、鉴定、克隆、基因文库建立、遗传多样性研究等。
主要收录情况及所获奖项
中国科学引文数据库(CSCD)核心库（Q1区）（2007年后连续入选）
北大版《中文核心期刊要目总览》（ 2008、2011、2014、2017、2020年连续入选）
中国学术期刊综合评价数据库（Q1区）
中文科技期刊数据库（Q1区）
中国科技核心期刊（2007年后连续年入选）
《世界期刊影响力指数（WJCI）报告》
CA化学文摘(美)（2014，2021）
JST 日本科学技术振兴机构数据库(日)(2018，2021)
CABI(国际应用生物科学中心)(2021)
中国农林核心期刊
荣获全国优秀农业期刊学术类二等奖 （2004年 、2008年）
2015年被中国自然资源学会评选为“高影响力十佳期刊”
2017年、2020年连续入选中国精品科技期刊
2021年在第一届农业科技期刊出版奖遴选活动中荣获“年度影响力期刊”
主要学术影响力
在刊物的编辑出版过程中，由中国工程院刘旭院士担任主编，6名资源领域专家担任副主编并轮流担任各期的责任主编，始终坚持正确的舆论导向，严格筛选稿件，保证刊发论文有较高的科学性和创新性，进而保证了期刊的较高学术影响力。
自创刊以来，期刊的影响因子逐年提升，据中信所《中国科技期刊引证报告》（核心版）数据统计，2021年《植物遗传资源学报》核心影响因子1.884。据中国知网统计，综合影响因子达 2.109。
在中国科学文献计量评价研究中心发布的《世界学术期刊学术影响力指数（WAJCI）年报》中，《植物遗传资源学报》2020年在农艺学137种期刊中排名51，Q2区。